企业股东转让股权，企业所得税收入的确认时点与个人股东不同。根据国家税务总局的规定，企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现。
（一）国税函〔2010〕79号文规定
根据相关规定，企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现。
（二）两个条件同时满足
收入确认需要两个条件同时满足：转让协议生效；完成股权变更手续（即工商变更登记完成）。两者缺一不可。
（一）计算公式
股权转让所得 = 股权转让收入——取得股权所发生的成本。
（二）不得扣除留存收益
企业在计算股权转让所得时，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额。
这是企业股东转让股权与企业清算退出的重要区别。清算时，留存收益可视为股息红利所得享受免税待遇；但股权转让时，留存收益不得扣除，须全额计入转让所得。
（一）季度预缴
股权转让所得应并入企业当期应纳税所得额，在季度终了后15日内预缴企业所得税。基本税率为25%。
（二）年度汇算清缴
年度终了后5个月内，进行汇算清缴，多退少补。
（一）收入确认与企业所得税申报的衔接
工商变更完成后，企业应及时将该笔转让所得并入当期应纳税所得额，避免漏报。
（二）亏损弥补
如企业当期存在亏损，股权转让所得可先用于弥补亏损，弥补后仍有余额的，再计算缴纳企业所得税。
北京登尼特可提供企业股东股权转让与申报服务，包括收入确认时点规划、股权原值核查、企业所得税预缴与汇算清缴申报等。此外，北京登尼特主营业务还包括外资公司注册、分公司注册、代表处注册、公司变更注销、代理记账、税务申报、审计报告、进出口权备案、食品经营许可证、工作签证代办、商标注册、境外投资备案等。
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