降解组测序技术 基因表达技术 基因服务技术 基因编辑技术 飞凡检测
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- 苏州飞凡检测科技有限公司
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- 更新时间
- 2024-05-23 18:00
降解组测序,也称为降解组测序技术,是一种针对mirna介导的剪切降解片段进行深度测序的技术。其主要目的是从细胞或组织中准确高效地筛选出mirna的靶基因,并确定降解片段与mirna的jingque配对信息。
在生物体内,mirna除了抑制mrna的翻译外,也会诱导mrna被剪切降解,从而调控基因表达,发挥生物学功能。降解组测序技术利用高通量测序平台批量鉴定mirna真实靶基因,是阐释mirna复杂调控机制的关键。
降解组测序技术的优势主要包括以下几点:
1. 高通量:一次测序可以鉴定出成百上千条mirna作用的靶基因,远胜于传统的5’race方案。
2. 数据质量高:提供q30(phredscore)以上的数据,确保数据分析的准确性。
3. 数据分析软件优:拥有自主开发的数据分析软件acgt301-deg101,并结合cleaveland,可靠性已经过大量实验项目检验。
4. 文库构建快速可靠:使用全新优化的文库构建方案,使得样本起始量更少、建库步骤更简单、测序读长更长,同时pcr扩增次数和割胶纯化次数更少。
5. 准确性高:从几个到数十万个拷贝的jingque计数。
6. 高分辨率:可以检测单个碱基的差异。
7. 重复性好:通过对文库的深度测序保证了检测的随机性,不需要技术重复,方便快捷。
降解组测序技术的应用场景非常广泛,主要包括以下几个方面:
1. 基因表达研究:通过降解组测序技术,可以深入了解基因的表达情况,包括基因的转录、剪切和降解等过程,从而揭示基因的表达调控机制。
2. 疾病研究:降解组测序技术可以用于研究疾病的发生和发展过程,特别是与mirna相关的疾病。通过鉴定mirna的靶基因,可以了解疾病的发病机制,并寻找新的治疗方法和药物靶点。
3. 药物研发:在药物研发过程中,降解组测序技术可以用于研究药物的靶点和作用机制。通过鉴定药物作用的靶基因,可以评估药物的疗效和安全性,并为新药研发提供有力支持。
4. 生物进化研究:降解组测序技术也可以用于研究生物的进化历程,特别是mirna的演化过程。通过比较不同物种的mirna和靶基因,可以了解物种间的亲缘关系和进化历程。
5. 农业育种:在农业领域,降解组测序技术可以用于研究农作物中的基因表达和调控,以及鉴定与抗病、抗虫、抗逆等性状相关的基因。这有助于培育出优良的新品种,提高农作物的产量和品质。
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