无土栽培还可以避免土壤连作障碍。常规土壤栽培中，特别是在设施栽培中，多年栽培同一种作物，土壤中往往会积累大量离子、土传病害等对植株有害的物质，造成土壤养分平衡，发生连作障碍。耗工费力的“客土”方法虽能够解决连作障碍，但生产成本过大。而无土栽培，特别是采用水培，无土栽培技术，则从根本上解决了此问题。无土栽培还能够从根本上杜绝土传病害。
植物工厂是通过设施内高精度环境控制实现农作物周年连续生产的农业生产体系，利用控制系统、电子传感系统、设施终端系统对植物生长的温度、湿度、光照、co2浓度以及营养液等环境条件进行自动控制，使设施内植物的生长发育不受或很少受自然条件制约的智能型立体型农业。植物工厂是现代农业的重要组成部分，是科学技术发展到一定阶段的必然产物，是现代生物技术、建筑工程、环境控制、机械传动、材料科学、设施园艺和计算机科学等多学科集成创新、知识与技术高度密集的农业生产方式。
无土栽培可以完全代替天然土壤的所有功能，花卉无土栽培，可以为作物提供更好的水、肥、气、热等根际环境条件。人类可以用无土栽培代替土培，无土栽培，但它的推广应用需要有一定的设备、技术条件和相当的经济基础，无土栽培设施，而且要求一定的社会化生产程度，在现阶段或今后相当长的时期内，无土栽培不能完全取代土培，只能够作为土壤栽培的一种补充形式，只有这样才能从根本上把握无土栽培的应用范围和价值。
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