医疗机构执业许可证实行定期校验制度，诊所通常每年校验一次，综合医院等规模较大的机构每三年校验一次。按时完成校验是诊所合法经营的重要义务。
诊所须在执业许可证有效期届满前的规定时间内提交校验申请，通常为到期前1-3个月。逾期申请的，卫生行政部门可暂停其执业活动，直至完成校验。
一般包括：校验申请书、执业许可证原件、医疗机构年度工作报告、法定代表人或负责人身份证明、诊疗科目和人员变动说明、医疗废物处置合同、消防合格证明等。各地要求存在差异，建议提前与当地卫生局确认清单。
卫生行政部门通常会对申请校验的诊所进行现场核查，重点检查：实际开展的诊疗科目是否与许可证一致、执业人员是否均已完成注册、诊疗区域是否符合标准、感染防控制度是否健全。
校验通过后，卫生行政部门在执业许可证上注明新的有效期，诊所可继续正常运营。若存在整改项，须在规定期限内完成整改并重新接受核查。
校验前须确保诊所人员（尤其是法定代表人和负责人）信息与证件一致，若有变动应提前办理变更手续，再进行校验申请。
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