快手店铺主体变更审核未通过时，应采取以下措施。
首先，登录后台查看具体的拒审原因。如果是因为材料不齐全，需根据要求补充相应的文件，例如控股股东证明需要工商部门出具的文件，之后重新提交申请。
若因主体关系不符合规定而被拒绝，则需先调整主体之间的关系，确保符合平台的要求后，再次提出变更申请。
在整个过程中，务必保证所提供的信息真实有效，并且严格按照快手的规定操作，以提高审核通过率。
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