当公司纳税额不够申请两地车牌时，可通过利用特殊政策、企业并购重组、集团纳税合并、捐赠公益事业或申请临时通行许可等途径实现目标。以下是具体分析和建议：
外资高新技术企业：被列入国家高新技术企业名录的外资企业，无需提供纳税证明，可直接申请粤港商务车指标。这为企业提供了一条免纳税申请的捷径。
人才和官员类申请：在港澳工作的中国科学院院士、中国工程院院士和港澳地区大学的现任校长，以及持有广东省人才优粤卡A卡的港澳台、外籍人士，可以申请粤港/粤澳车牌指标。此外，港澳籍全国人大代表或，以及海外华人华侨、港澳台同胞在广东省捐赠兴办公益事业累积金额达一定标准的，也可以申请车牌。
收购满足纳税条件的企业：企业可以通过收购满足纳税条件的企业来直接申请办理两地车牌。这种方式虽然需要一定的资金投入，但能够快速获得车牌指标。
转让持有两地车牌的企业股份：企业也可以通过转让持有粤港两地车牌的企业股份来获得车牌。这种方式同样需要关注企业的合法性和车牌的有效性。
对于集团企业而言，可以通过将集团内多家子公司的纳税额合并计算，快速达到高阶梯申请门槛。例如，若集团在广东有3家子公司，A公司纳税8万元、B公司纳税10万元、C公司纳税12万元，合并后累计纳税30万元，可申请港珠澳大桥口岸2辆粤Z车牌（需满足3年累计10万元/辆的梯度）。这种方式需要确保子公司间存在合理商业关联，避免被税务部门认定为“人为拆分纳税主体”。
企业向广东省慈善机构捐赠达一定金额（如100万元以上），可申请两地车牌指标。这种方式既体现了企业的社会责任感，又能够获得车牌指标，但需要关注捐赠证明的有效性和审核流程。
对于短期商务或活动需求，企业可以申请临时入境许可。澳门车辆可通过“澳车北上”政策进入广东，无需企业纳税要求，但车辆需符合内地环保标准，并购买跨境保险。这种方式有效期一般为3个月至1年，适用于临时性需求。
