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重庆工厂屋顶光伏发电的优势主要包括以下几点：

节能减排：光伏发电是一种清洁能源，安装光伏发电能实现节能减排，减少对化石燃料的依赖，从而减少温室气体的排放，有助于减缓全球气候变暖。

稳定可靠：光伏发电可以在太阳能充足时自行发电，不依赖外部电源，而且寿命长、维护成本低，稳定性强。

降低能源成本：光伏发电可以使企业不再完全依赖于电力公司供电，降低用电成本，因为太阳能是免费的。

公共形象：企业安装光伏系统也可以树立公众意识，表明企业正在开展可持续发展项目，社会责任心强。

政策支持：许多国家和地区都对光伏发电给予了大力的政策支持，包括补贴、税收优惠等。这些政策可以大大降低光伏发电系统的安装成本，使得更多的人能够接受和使用光伏发电。

提高能源安全：依赖化石燃料的电力系统容易受到各种因素的影响，如战争、天灾等。而光伏发电则不依赖于这些不稳定的因素，可以提高能源的安全性。

然而，重庆工厂屋顶光伏发电也存在一些弊端：

照射的能量分布密度小：要占用巨大面积才能获得足够的能量。

获得的能源同四季、昼夜及阴晴等气象条件有关：白天有光照可以使用，晚上则无法使用。

相对于火力发电，发电成本高。

综上所述，重庆工厂屋顶光伏发电在节能减排、降低能源成本等方面具有明显优势，但也存在一些需要克服的弊端。在实际操作中，需要综合考虑各种因素，合理规划布局，以充分发挥其优势。