酵素辅助体内所有的功能。在水解（hydrolysis）反应中，消化酵素分解食物颗粒，以贮存於肝或肌肉中，此贮存的能量稍后会在必要时，由其它酵素转化给身体使用。酵素也利用摄取进来的食物以建造新的肌肉组织、神经细胞、骨骼、皮肤或腺体组织。例如，有一种酵素能转化饮食中的磷为骨骼。
这些重要的营养素也协助结肠、肾、肺、皮肤等排出毒素。例如，有一种酵素催化尿素的形成，此氨化物经由尿液排出，另一种酵素使二氧化碳由肺部排出。
除此，酵素还分解有毒的过氧化氢（hydrogenperoxide），并将健康的氧气从中释放出来。由於酵素的作用，使铁质集中於血液，酵素也帮助血液凝固，以停止流血。酵素也促进氧化作用，此过程中氧会被结合到其它物质上。氧化作用会制造能量。酵素也将有毒废物转变成容易排出体外的形式以保护血液。
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