中药临床应用造成了非常不利的影响。2019年6月11日，国家卫生健康委办公厅和国家中医药局办公室联合印发了批国家重点监控合理用药药品目录（化药及生物制品）的通知。通知尽管只列出20种“化药及生物制品”，并没有中药，但要求“加强目录外药品的处方管理”，明确规定，对于中药，其他类别的医师，经过不少于1年系统学习中医药知识并考核合格后，遵照中医临床基本的辨证施治原则，可以开具中成药处方。这被解读为“西医不能开中药”，这一规定，对于一些在临床中一直使用中药的临床医生造成了很大影响。
除此而外，出于控制医疗费用不合理增长，很多地方在药品招标采购中将临床用药人为划分了治疗用药和辅助用药，很多中药被作为“辅助用药”享受了“特殊”待遇，一些大三甲医院直接将中药注射剂踢出医院。
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