我注册了一家注册资本为100万的公司，后来不想经营了，需要补全这100万吗？

不需要。但是如果公司有债务时，需要把债务先偿还清，再走正常的注销流程。“认缴制”只是不用现在一次性把钱掏出来，但是承担的法律责任是在的。你需要按照你所占的股份的金额，承担对应的债务责任。