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冠状病毒(229E/NL63)PCR检测试剂盒

发布时间: 2015-05-28

产品名称:冠状病毒(229e/nl63)pcr检测试剂盒

产品编号:btn29094

产品规格:50t

产品保存:-20℃

pcr反应的影响因素:

退 火温度与时间:退火温度决定pcr特异性与产量。温度高特异性强,但过高则引物不能与模板牢固结合,dna扩增效率下降;温度低产量高,但过低可造成引物 与模板错配,非特异性产物增加。合适的退火温度一般在45~68℃之间。设置特定反应的适退火温度,可根据引物的(g+c)%含量进行推测,一般实验中 退火温度比扩增引物的熔解温度tm低5℃,退火时间一般为30~60秒,足以使引往返与模板之间完全结合,长时间退火没有必要。

引 物:引物与模板配对的长度应到少为17个核苷酸,高不宜超过30个核苷酸,长度为20~24个核苷酸,如需插入酶切位点,应在酶切位点5’端多加几 个碱基,有利于酶切。引物的(g+c)%含量组成应均匀,尽量避免含有相同的碱基多聚体。两个引物中(g+c)%含量应尽量相似。引物内部应避免形成明显 的次级结构,如发夹结构。两个引物之间不应发生互补,特别是在引物3’端。如果可能,引物3’端富有gc,这样退火后有利于引物3’端的延伸。人工合 成的引物经验丰富色谱层析或page纯化,以除去未能合成至全长的短链等杂质。引物的终尝试一般为0.1-2 μm左右,尝试太高会导致非特异性扩增,太低则扩增产物太少。

酶量:50 μl反应体系可用0.5-5 u酶,酶量的选择与模板dna的量,扩增片段大小等有关,酶量过多易发生非特异性反应,而且可能增加突变的机率,尤其在进行高保真扩增时,应尽量减少酶量,但酶量过少时反应性能下降。

模 板:模板可以是单链dna,也可以是双链dna,质粒dna的扩增效率略低于线状dna。模板加量一般不需太多,不超过1 μg为宜,因为加量过多可能导致非特异性扩增增加,但是要考虑模板中靶序列的含量。例如,使用基因组为模板扩增单拷贝或低拷贝靶序列,就需要适当加大模板 用量。

变 性温度与时间:模板变性温度是决定pcr反应中双链dna解链的温度,达不到变性温度就不会产生单链dna模板,pcr也就不会启动。变性温度低则变性不 完全,dna双链会很快复性,因而减少产量。变性温度太高,又会影响酶的活性。一般情况下可设为94℃ 20~30秒,高温时间应昼缩短,以保持耐热dna聚合酶的活力,高变性温度不宜超过95℃。

延 伸温度与时间:pcr反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,延伸时间根据所用聚合酶扩增速度和扩增片段大小设定,如同样扩增2 kb片段,若使用taq酶只需1分钟,使用pfu酶则应设定2分钟以上。延伸时间过长会导致非特异性扩增带的出现,时间太短则可能得不到扩增产物或得到一 些短的非特异性片段。

循环次数:可根据模板dna的量、扩增片段的大小和扩增产物的下步应用等因互,设定20-40个循环。循环次数太少,扩增量不足,如果循环次数太多,错配几率会增加,非特异性背景严重。所以,在保证产物得率前提下,应尽量减少循环次数。

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