消毒药必须广谱、强力、无毒、无害、刺激性小和无腐蚀性。如碘制剂、碘酸制剂、有机氯制剂、离子表面活性剂等，百毒杀、抗毒威、新洁尔灭、****或次氯酸钠以及一些复合的消毒剂等都是常用的消毒剂。一般不选用那些有刺激的消毒剂如火碱、甲醛、戊二醛等。

各种消毒剂使用时要注意消毒器械的选择，有些药剂不能在加热后使用，热烟雾消毒就需要使用能加热的药剂。