武汉惠华三农种业有限公司于2005年注册成立，为适应种业新形势发展要求，于2012年进行重组。重组后的武汉惠华三农种业有限公司，是由新疆科润惠华农业科技有限公司、中国科学院微生物研究所、武汉华中农大资产经营有限公司共同出资组建的以水稻、棉花、油菜种子育、繁、推一体化经营为主要业务的一家现代种业公司。现有员工50余人，注册资本5000万元，计划2012年底增资扩股将公司注册资本增加为1亿元，申报杂交水稻、杂交棉花等主要农作物国家经营许可证。公司拥有的科研平台和雄厚的资金实力，建有稳固的种子生产基地及完善的营销服务网络，研发能力及分子检测水平在同行业。到目前为止，公司通过多种育种技术育成了多个各具特色、极具开发价值的水稻、油菜不育系和恢复系，独占开发Ⅱ优1259、华两优1206、两优363、金优39、惠两优369、惠两优1号、惠两优2817、两优6188、惠两优6812、惠两优7408、华两优106、新香优118、润杂棉5号、润杂棉4号、润杂棉3号、科杂棉2号、科抗棉1号、科抗棉2号、惠油杂6815、惠玉537等一批、高产、多抗的杂交水稻、杂交棉花、杂交油菜和杂交玉米新品种。拥有两个抗虫基因（专利号：ZL01129519.8、ZL01103759.8）在棉花上的独占实施许可权和其他作物上的实施分许可权，同时在水稻基因创新、定位、鉴定以及绿色超级稻育种与技术开发等方面取得了重大阶段性成果，居于水平。公司本着以人为本、科学运作，技术至上、稳健发展的理念，在华中、华东、华南建立了销售服务中心，组建了覆盖长江中下游流域的市场营销网络与技术服务体系，并依托科技优势积极拓展国际市场，着力打造惠华品牌，公司的宗旨是让惠华良种惠泽中华大地。